本病應(yīng)與以下疾病相鑒別：

　　(1)致密性骨發(fā)育障礙：該患兒矮小，顱蓋骨增大,額枕骨突出，常見有縫間骨，末節(jié)指骨發(fā)育不全，長(zhǎng)骨密度增高但骨髓腔存在，患兒無(wú)貧血。

　　(2)顱骨干骺發(fā)育不全：顱骨進(jìn)行性增大變厚，骨質(zhì)不脆，多在5歲以后才有表現(xiàn)。

　　(3)顱骨骨干發(fā)育不全：主要表現(xiàn)為“獅面”增生，其他部位無(wú)骨破壞，骨塑形不佳，鎖骨及肋骨增寬。

　　(4)新生兒骨硬化：通常在1個(gè)月內(nèi)消失。

　　(5)貧血或白血病時(shí)并發(fā)的骨髓纖維化：有時(shí)很難與大理石骨癥相鑒別，只有借助血液檢查及骨髓穿刺檢查。

　　(6)氟骨癥：因?yàn)榉前Y累及頭顱時(shí)，也可表現(xiàn)為顱板增厚，密度增高，特別是顱底可出現(xiàn)明顯硬化。但是氟骨癥為慢性氟中毒所致，病人有氟化物長(zhǎng)期接觸史或長(zhǎng)期飲水含氟量超過(guò)允許量及用氟化物治療骨髓瘤、骨質(zhì)疏松癥的病史。氟骨癥不如石骨癥那樣均勻致密，同時(shí)氟骨癥病變以軀干為主，而向四肢遞次減弱，骨紋增粗呈網(wǎng)眼樣改變，晚期可見韌帶鈣化和骨間膜鈣化，而不具備石骨癥的上述特征。氟骨癥尿化驗(yàn)氟化物高達(dá)8mg/L以上。

　　另外本病還需與重金屬中毒、維生素D中毒、甲狀腺機(jī)能低下及先天性梅素等區(qū)別。