引起肛周膿腫的病因較多，主要原因有以下幾個(gè)方面：
醫(yī)源性因素（8%）：
臨床上屬醫(yī)源性引起的肛門直腸周圍膿腫也不少見。① 內(nèi)痔插枯痔丁或注射療法，因操作不當(dāng)或藥劑不潔感染形成粘膜下膿腫。② 直腸周圍注射化學(xué)藥物刺激，引起組織壞死，造成直腸周圍膿腫。③ 乙狀結(jié)腸鏡檢查，造成腹膜穿孔感染，引起直腸后間隙膿腫。④ 局部麻醉感染，或油溶液注入后吸收不良，而形成膿腫。
手術(shù)后因素（15%）：
臨床上亦可見到肛門直腸手術(shù)引起感染，而形成的直腸周圍膿腫，以及尿道術(shù)后感染、會陰部術(shù)后感染、產(chǎn)后會陰破裂縫合后感染、尾骶骨骨髓炎術(shù)后感染等引起的膿腫。
感染性因素（30%）：
現(xiàn)代醫(yī)學(xué)認(rèn)為，感染是引起本病的主要原因。
其它因素（13%）：
直腸內(nèi)異物損傷后感染，放線菌病，直腸憩室炎感染，肛管直腸癌破潰或波及深部的感染，及身體虛弱，抵抗力低下，或患有慢性消耗性疾病，或營養(yǎng)不良，都是肛門直腸周圍膿腫的發(fā)病原因。