(一)藥物治療
目前藥物治療無法改變孤獨癥的病程，但可能在某種程度上控制某些癥狀。使用的藥物有抗精神病藥、中樞神經(jīng)興奮劑、抗組織胺類藥、杭抑郁制劑、理鹽和維生素等，療效均無定論。
(二)行為治療
治療重點應放在促進孤獨癥兒童的社會化和語言發(fā)育上，盡量減少那些干擾兒童功能和與學習不協(xié)調(diào)的病態(tài)行為，如刻板、自傷、侵犯性行為。行為治療的原則。第一，治療方案應個別化。第二，幫助兒童盡量能把在醫(yī)院及學校習得的技巧，移植到家里或其他場合。第三，治療的另一目的是促進兒童的社會化發(fā)育，故不宜長期住院。
(三)教育治療
教育的目標重點應該是教會他們有用的社會技能，如日常生活的自理能力，與人交往的方式和技巧;與周圍環(huán)境協(xié)調(diào)配合及行為規(guī)范，公共設(shè)施的利用的等最基本的生存技能。
教育訓練要特別注意個別化。教育訓練開始的年齡越小越好，獲得后越容易固定下來。教育訓練中要特別注意父母所起的作用。教育訓練還應做到堅持和長期性，教師和父母要懂得不能期望在短期的訓練中改變兒童的行為或一定能學會一項技能。
(四)中醫(yī)點穴治療
中醫(yī)學認為，智力活動是屬于五臟六腑之功能，腎為先天之本，主骨主髓，心為君之宮而主神明;肝為將軍之宮而主謀慮，小幾先天稟賦不足或后天失養(yǎng)，均可導致心、肝、腎等臟腑受損，使髓海不充，神智衰弱，謀慮失常，而產(chǎn)生智力低下病癥。根據(jù)這一原理，顏家睦同志首創(chuàng)中醫(yī)點穴方法治療孤獨癥兒童，選用特定的啟智區(qū)、神智區(qū)、益智區(qū)、聰智區(qū)等點之，以健腦益智，開竅寧神，調(diào)和任督兩脈：在四肢及背部的8條刺激線和特定穴位等點之，以起到醒腦開竅，壯腎開元，益氣補脾，充盈精血之功效;再輔以配穴點之，以調(diào)肝健腦，平肝息風，化痰開竅。從而，調(diào)整五臟六腑的經(jīng)氣，改變臟腑虛實狀態(tài)，促進大腦細胞發(fā)育，提高兒童智力?，F(xiàn)代醫(yī)學認為，刺激某些穴位可改善大腦皮質(zhì)的微循環(huán)，使大腦組織血流量增加，改善腦組織的營養(yǎng)物質(zhì)及氧氣供應量，促進代調(diào)產(chǎn)物的排泄，因此，點穴治療對智力低下有明顯改善作用。
心理學認為，通過刺激體表穴位，讓孩子感到接觸舒適，產(chǎn)主肌膚之情，這樣孩子容易產(chǎn)主安全感，施術(shù)者容易與孩子建立融洽關(guān)系，有利于促進孩子的社會交往。