與大細胞癌相區(qū)分的依據(jù)是鱗狀分化是否存在。局部可存在胞內粘蛋白。即使侵襲性生長未得到確定，如果具有明顯的細胞不典型也可確定乳頭狀型SCC的診斷。小的活檢標本表現(xiàn)分化良好的乳頭狀鱗狀上皮時診斷應謹慎，因為乳頭狀鱗癌與乳頭狀瘤的區(qū)分是困難的。肺的疣狀癌非常罕見，包括在乳頭狀鱗癌之中。前縱隔組織廣泛侵襲可導致與胸腺鱗狀細胞癌鑒別診斷困難，需要與手術和放射學檢查結果相結合。在 肺間質中，鱗狀細胞癌可被肺泡細胞包繞，有時可被誤診為腺鱗癌。在彌漫性肺泡破壞（DAD）中存在鱗狀化生伴細胞不典型應考慮鱗狀細胞癌的可能。DAD的一般特征表現(xiàn)如透明膜、彌漫性肺泡隔結締組織增生伴肺泡細胞增生和 細支氣管中心性鱗化等有利于認為DAD是一種化生的病變過程。